Comptabilité d'une Holding : le Guide Complet
Régime mère-fille, liasse IS, remontée de dividendes : voici comment gérer la comptabilité de votre holding en 2026, en autonomie avec un logiciel ou accompagné par un expert-comptable en ligne.
⚡ En bref : pour une holding passive, un logiciel comme Indy gère désormais la holding nativement (régime mère-fille, solde d'IS, télétransmission) dès 49 € HT/mois. Pour une holding animatrice ou une intégration fiscale, un expert-comptable en ligne reste le choix le plus sûr.
1. Qu'est-ce qu'une Holding (et sa Compta) ?
Une holding est une société dont l'objet est de détenir des participations dans d'autres sociétés (les filiales). Le plus souvent constituée en SAS, SASU ou SARL à l'impôt sur les sociétés (IS), elle sert à organiser un groupe, faire remonter des dividendes, réinvestir ou préparer une transmission. Si votre holding n'est pas encore constituée, vous pouvez comparer les offres de création sur CréaCompare.
Holding passive
Se limite à détenir des titres et percevoir des dividendes. Comptabilité simple : peu d'écritures, mais liasse IS et régime mère-fille à maîtriser.
Holding animatrice
Rend des services à ses filiales (management fees, direction, RH). Comptabilité plus lourde : TVA, prestations intra-groupe, refacturations.
💡 Cette distinction est décisive : une holding passive peut souvent être gérée en autonomie avec un logiciel, tandis qu'une holding animatrice (ou avec intégration fiscale) justifie l'accompagnement d'un expert-comptable.
2. Obligations Comptables d'une Holding
Une holding à l'IS est soumise aux mêmes obligations qu'une société commerciale classique :
Comptabilité commerciale complète
Livre-journal, grand livre, bilan et compte de résultat en partie double.
Liasse fiscale IS (2065)
Déclaration de résultat, solde d'IS et télétransmission à la DGFiP via une procédure EDI-TDFC.
Dépôt des comptes annuels
Dépôt au greffe du tribunal de commerce, avec option de confidentialité pour les petites sociétés.
TVA (si prestations)
Une holding animatrice qui facture des management fees est assujettie à la TVA et dépose des déclarations.
3. Régime Mère-Fille et Dividendes
Le régime mère-fille est le principal levier fiscal d'une holding. Il permet, sous conditions, de percevoir les dividendes de ses filiales en quasi-exonération d'IS.
Le principe
Si la holding détient au moins 5 % du capital de sa filiale pendant au moins 2 ans, les dividendes remontés sont exonérés d'IS, à l'exception d'une quote-part de frais et charges de 5 % réintégrée au résultat. Résultat : seuls 5 % des dividendes sont effectivement taxés à l'IS.
Ce mécanisme, combiné à l'intégration fiscale pour les groupes plus importants, fait de la holding un outil puissant de réinvestissement. Pour aller plus loin, consultez notre guide dédié : régime mère-fille et remontée de dividendes.
4. Logiciel ou Expert-Comptable ?
Depuis 2026, gérer une holding sans expert-comptable est devenu réaliste pour les structures simples, grâce aux logiciels qui intègrent nativement les spécificités des holdings.
Indy : logiciel autonomie
Indy gère désormais la holding nativement : régime mère-fille, déclaration de solde d'IS et télétransmission directe aux impôts, en autonomie totale, à partir de 49 € HT/mois. Idéal pour une holding passive.
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5. Comparatif des Solutions Holding
6. Holding et Facturation Électronique 2026
Si votre holding facture des prestations à ses filiales (management fees, refacturations), ces factures B2B sont concernées par la réforme de la facturation électronique. Elles devront transiter par une Plateforme Agréée (PA) : réception obligatoire pour toutes dès le 1er septembre 2026, émission entre le 1er septembre 2026 (grandes entreprises, ETI) et le 1er septembre 2027 (PME, TPE).
7. Questions Fréquentes
Peut-on gérer la comptabilité d'une holding sans expert-comptable ?
Oui, c'est possible si votre holding est une holding passive (simple détention de titres) et que vous êtes autonome. Des logiciels comme Indy prennent désormais en charge les spécificités d'une holding à l'IS : régime mère-fille, déclaration de solde d'IS et télétransmission directe aux impôts, à partir de 49 € HT/mois. Pour une holding animatrice ou avec intégration fiscale, un expert-comptable en ligne (Dougs, Numbr) reste recommandé.
Une holding est-elle obligée d'avoir une comptabilité ?
Oui. Une société holding (le plus souvent une SAS, SASU ou SARL à l'IS) doit tenir une comptabilité commerciale complète : livre-journal, grand livre, bilan, compte de résultat et liasse fiscale (formulaire 2065). Elle dépose ses comptes annuels au greffe, sauf option de confidentialité pour les petites sociétés.
Combien coûte la comptabilité d'une holding ?
En autonomie avec un logiciel spécialisé holding (Indy), comptez environ 49 € HT/mois. Avec un expert-comptable en ligne, prévoyez 69 à 150 € HT/mois selon la structure (Dougs dès 69 € HT/mois pour une SASU). Un cabinet traditionnel facture souvent 1 500 à 3 000 € HT/an pour une holding simple.
Qu'est-ce que le régime mère-fille pour une holding ?
Le régime mère-fille permet à une holding détenant au moins 5 % du capital d'une filiale de percevoir ses dividendes en quasi-exonération d'IS : seule une quote-part de frais et charges de 5 % est réintégrée et taxée. C'est le principal levier fiscal d'une holding pour faire remonter et réinvestir la trésorerie.
La facturation électronique 2026 concerne-t-elle les holdings ?
Oui, dès lors que la holding facture des prestations (management fees, refacturations intra-groupe) à ses filiales. Ces factures B2B devront transiter par une Plateforme Agréée : la réception devient obligatoire pour toutes les entreprises dès le 1er septembre 2026, et l'émission dès le 1er septembre 2026 pour les grandes entreprises et ETI, puis le 1er septembre 2027 pour les PME, TPE et micro-entreprises. Une holding purement passive sans facturation reste au minimum soumise à l'obligation de réception.
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Indy gère la holding nativement dès 49 € HT/mois. Pour un accompagnement humain, Dougs prend en charge votre comptabilité de A à Z.